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    新型蛋白質(zhì)改造方法成功開發(fā)

    時(shí)間:2025-08-13 10:41:20   來源:科技日?qǐng)?bào)

      記者8月11日從中國科學(xué)院遺傳與發(fā)育生物學(xué)研究所獲悉,該所科研人員聯(lián)合其他單位的科研人員,成功開發(fā)了一種基于人工智能(AI)的新型蛋白質(zhì)改造方法。該方法巧妙地利用了現(xiàn)有通用蛋白質(zhì)逆折疊AI模型,無需訓(xùn)練專屬AI模型,即可實(shí)現(xiàn)蛋白質(zhì)高效進(jìn)化模擬和功能設(shè)計(jì)。相關(guān)研究成果日前在線發(fā)表于《細(xì)胞》。

      蛋白質(zhì)改造就像給生物分子做“改裝”,通過調(diào)整氨基酸順序改變蛋白質(zhì)性能。相較于基因改造,蛋白質(zhì)改造更為直接高效,能夠快速獲得自然界歷經(jīng)百萬年進(jìn)化才可能產(chǎn)生的特性。

      然而,現(xiàn)有的蛋白質(zhì)改造技術(shù)存在明顯短板:傳統(tǒng)方法高度依賴專家經(jīng)驗(yàn),耗時(shí)長、成本高;而新興的AI預(yù)測技術(shù)需要為每種蛋白質(zhì)單獨(dú)訓(xùn)練專用模型,不僅通用性差,還特別消耗計(jì)算資源。“面對(duì)這些挑戰(zhàn),我們急需找到一種更‘聰明’的辦法,開發(fā)出通用性強(qiáng)、效率高且不依賴昂貴算力的新型AI解決方案。”論文通訊作者、中國科學(xué)院遺傳與發(fā)育生物學(xué)研究所研究員高彩霞說。

      現(xiàn)有通用蛋白質(zhì)逆折疊AI模型,可根據(jù)給定的三維結(jié)構(gòu),預(yù)測蛋白質(zhì)可能的氨基酸排列。基于現(xiàn)有通用蛋白質(zhì)逆折疊模型,科研人員開發(fā)了AiCEsingle模塊,推出了一種新型蛋白質(zhì)改造方法。

      測試結(jié)果發(fā)現(xiàn),新方法的預(yù)測準(zhǔn)確率達(dá)16%,性能比其他常見AI模型提升36%—90%。同時(shí),在實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證環(huán)節(jié),科研人員用新方法成功改造了8種功能各異的蛋白質(zhì),包括基因編輯關(guān)鍵工具脫氨酶等。

      高彩霞表示,這個(gè)智能蛋白質(zhì)改造新方法,相比傳統(tǒng)手段效率更高、適用性更廣、擴(kuò)展性更強(qiáng)。它代表著生命科學(xué)領(lǐng)域的重要趨勢,即用計(jì)算模擬部分替代實(shí)驗(yàn)室操作。特別值得一提的是,新方法大幅降低了AI技術(shù)的使用門檻,普通實(shí)驗(yàn)室無需配備昂貴算力就能享受智能預(yù)測的便利,讓更多科學(xué)家受益。

    (責(zé)任編輯:華康)

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